Sorprendido por la determinación de Naruto, Nagato le dijo que creerá y que dejará todos sus sueños en él. Nagato realiza una técnica con la cual revivió a todos los aldeanos de Konoha a costa de su vida. Naruto ayudó a Konan a encontrar los cuerpos de Pain y Yahiko, para luego ser enterrados en la Aldea Oculta de la Lluvia. Konan, al afirmar que dejaría Akatsuki, le regaló un ramo de rosas a Naruto, simbolizando su alianza.